布置八卦阵需要同时满足四项硬条件：队伍中有至少5名未陷入战斗不能的武将，已经任命军师，当前军师达到八卦阵的习得等级，并且战斗开始后拥有足够的sp。八卦阵的习得等级为48级，发动一次消耗48点sp；它不能像散开阵、白马阵等阵型一样在大地图上提前设置，只能进入战斗后从策略或阵形指令中发动。若sp不足48点，即使已经达到等级、队伍人数也符合要求，指令仍无法正常使用。
先完成军师任命，再检查队伍人数和出战顺序，是成功布阵的基础。可任命军师的武将通常需要达到160点智力，军师的等级与智力会决定全队能够使用的策略和阵型，因此只看刘备军中是否有诸葛亮并不够，还要确认当前确实由满足条件的武将担任军师。游戏最多可编入7名武将，但实际战斗通常只取队列前5人；军师被安排在队伍末尾，队伍超过5人时可能无法进入战场。若希望军师本人也站在八卦阵的五个位置中，应将队伍控制在5人，并确保这5人都没有兵力归零或战斗不能。
实际操作应在战斗指令中选择策略或阵形，找到八卦阵后确认发动，再从5名出战武将中指定一人为生门。生门是八卦阵唯一会正常承受敌方普通物理攻击的位置，生门对应的死门遭到物理攻击时会反弹伤害，其余三名武将则处于物理攻击无法正常造成伤害的状态。生门应优先安排兵力较高、防御较稳或能够持续恢复队伍的武将；兵力较少、承担策略和恢复职责的脆弱军师不宜随意放在生门。部分中文版会直接显示生门和死门位置，若界面没有单独选择死门，通常会依据生门所在位置自动确定。
八卦阵的保护重点是普通攻击，不代表队伍对所有策略都免疫，因此面对火计、石计或其他高伤害策略时，仍要准备恢复手段并尽快处理敌方军师。敌人使用解阵计时，八卦阵也可能被直接解除；我方只要有一名武将战斗不能，阵形就会立即散开，比其他阵型更难维持。战斗结束后八卦阵同样不会保留，下一场需要重新消耗SP布置。常见的失败原因包括在地图上寻找八卦阵、队伍只有4人、当前SP不足、军师等级未达48级，以及把生门误放给低兵力武将。
实战准备可以按任命军师—确认等级—补足48点SP—整理5名健康武将—进入战斗—发动八卦阵—指定生门的顺序进行。前中期尚未达到48级时，不必反复寻找隐藏地点或特殊道具，八卦阵本身不会提前解锁；达到等级后，优先在敌方普攻强、战斗持续时间长的战斗中使用，并把高兵力武将放在生门位置。若敌方以策略伤害和解阵计为主，八卦阵的收益会明显降低，应先保证军师能够稳定行动，再决定是否消耗48点SP。
